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            技術(shù)文章 / article
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            子宮內膜癌精準分子分型標準品,助力POLE基因檢測

            原載自:www.yamifan.com[技術(shù)資料頻道]  2024-04-11  瀏覽次數:326

             

            2013年美國癌癥基因組圖譜(TCGA),依據子宮內膜癌全基因組、轉錄組、蛋白組等多組學(xué)檢測結果,將其分為POLE突變型、微衛星不穩定突變型、低拷貝數型和高拷貝數型等4種類(lèi)型。2023年國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)分期建議,所有的子宮內膜癌EC患者均應完善分子分型檢測。

             

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            圖1 子宮內膜癌分子分型檢測推薦路線(xiàn)

             

            2024年1月29日,美國國立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò )(National Comprehensive Cancer Network,NCCN )同時(shí)對結腸癌和直腸癌指南進(jìn)行了更新,升級為2024.V1版本。相比于2023 V6版NCCN指南,2024 V1版增加了POLE 和POLD1突變、RET融合基因的分子檢測說(shuō)明。


             

             

             

            POLE基因簡(jiǎn)介

             

             

            POLE 基因位于12q24. 33,由63762個(gè)堿基對組成,包含51個(gè)外顯子序列,POLE基因編碼 DNA聚合酶 Polε的催化亞基,該亞基包含催化結構域和核酸外切酶結構域,對 DNA復制過(guò)程中的校對功能至關(guān)重要。當POLE基因的外切酶結構域發(fā)生致病性突變、導致該蛋白在 DNA復制過(guò)程中無(wú)法及時(shí)執行錯配校對功能時(shí),腫瘤細胞的基因組會(huì )在細胞增殖過(guò)程中積累大量的復制錯誤,從而表現為超過(guò)正常細胞(通常<10個(gè)突變/Mb)10~100 倍以上的突變頻率。只有在腫瘤中檢出位于POLE基因核酸外切酶結構域(第9~14外顯子)的致病性突變,才能被診斷為POLE突變型,Pole基因突變可導致腫瘤的發(fā)生。

             

            目前研究發(fā)現,盡管POLE基因突變的腫瘤形態(tài)學(xué)高度惡性,但預后良好,對免疫制劑具有良好反應。

             
             
             

             

            POLE基因變異

             

            POLE突變包括體系突變和胚系突變,其中體系突變率為 6%~10%,胚系突變率 0.25%~4%,胚系突變具有遺傳性。POLE基因突變類(lèi)型包括核苷酸的重復、缺失和插入,大多數突變是非整倍體。POLE基因突變檢測包括熱點(diǎn)突變或POLE基因核酸外切酶結構域致病性突變。POLE基因核酸外切酶結構域包含外顯子 9~14,80%以上的致病性變異發(fā)生在 9號和13號外顯子。目前已確定包括 P286R、V411L、S297F、S459F、A456P、F367S、L424I、M295R、P436R、M444K 和 D368Y 位點(diǎn)在內的11個(gè) POLE基因的致病性突變位點(diǎn)。新的可能致病性突變位點(diǎn)正在被陸續報道,少數研究已經(jīng)證實(shí)了外切酶結構域以外的致病性突變,但其致病作用有待進(jìn)一步證實(shí)。

             
             
             

             

            POLE基因檢測

             

            目前POLE基因突變的檢測方法主要包括Sanger測序和第二代高通量測序(NGS)。Sanger測序的優(yōu)勢是成本低、精確度高,對于已知變異位點(diǎn)的檢測非常經(jīng)濟和高效,可以作為檢測的金標準,但最大的局限性是覆蓋度和靈敏度低,不能檢測到未知變異位點(diǎn)。NGS 技術(shù)具有通量大、精準度高和信息量豐富等優(yōu)點(diǎn),但由于檢測成本高、周期長(cháng),限制了NGS在臨床實(shí)踐中的推廣應用。此外,為降低檢測成本并提高檢測靈敏度,還可以對目標序列進(jìn)行雜交捕獲或擴增子富集后進(jìn)行靶向測序(targeted sequencing)。2021版《子宮內膜癌分子檢測中國專(zhuān)家共識》推薦條件允許的情況下對POLE基因9~14號外顯子區域進(jìn)行高通量靶片段測序,尤其是POLE基因核酸外切酶結構域的致病突變。

             

            子宮內膜癌精準分子分型標準品

            科佰生物推出了子宮內膜癌精準分子分型標準品,助力POLE基因檢測。部分數據展示如下:

             

            產(chǎn)品列表2.png

             

            AI-Edigene® POLE p.S297F Reference Standard Plus CBP10682

            CBP10682.jpg

             

            AI-Edigene® POLE p.V411L Reference Standard Plus CBP10684

            CBP10684.jpg

             

            AI-Edigene® POLE p.P286R Reference Standard Plus CBP10685

            CBP10685.jpg

             

            AI-Edigene® POLE p.F367S Reference Standard Plus CBP10689

            CBP10689.png

             

            AI-Edigene® POLE p.L424I Reference Standard Plus CBP10690

            CBP10690.png


             

             

             

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